根据“研究型学院”的目标定位，学院的科研工作紧扣国家生态保护的宏观战略，面向“全国野生动植物保护及自然保护区建设工程”与“全国湿地保护工程”，开展了大量研究工作。

近年来，学院教师承担了包括国家自然科学基金项目、国家科技支撑项目、林业公益性项目和“973”项目专题、国家林业局重点研究项目等课题440余项，科研经费累计已达1亿元。学院教师在国内外刊物共发表论文400余篇，其中在Science和PNAS等刊物上发表SCI论文140余篇，编写专著20余部，获批专利15项，发布国家或行业标准6项。学院促进科研团队建设，获批2个校级青年科技创新计划团队建设项目。