植物具有结构复杂的线粒体基因组，研究植物线粒体基因组的序列和结构，发掘植物其复制的机制，对理解植物的演化、能量产生和环境适应具有重要的意义。近期，草业与草原学院研究团队首次全面分析了匍匐翦股颖（Agrostis stolonifera）的线粒体基因组，揭示其总长为560,800 bp，GC含量为44.07%，是由三个连续染色体组成的分支结构。

图 1 匍匐翦股颖线粒体基因组结构

基因组注释揭示了33个独特的蛋白编码基因（PCGs）、19个tRNA基因和3个rRNA基因，丙氨酸和谷氨酰胺的主要密码子分别是GCU和CAA，而半胱氨酸和苯丙氨酸的密码子使用偏见较弱。该线粒体基因组在染色体1，2和3上分别包含73，34和23个简单序列重复（SSRs）。染色体1呈现最常见的A-重复单聚体SSR，而染色体2显示最常见的U-重复单聚体SSR。在线粒体基因组和叶绿体基因组之间鉴定了48个同源片段，占线粒体基因组总长度的3.41%。

图2 匍匐翦股颖线粒体与叶绿体基因组转移

PREP套件检测到33个线粒体PCGs中的460个C-U RNA编辑事件，其中ccmFn基因中最多，rps7基因中最少。系统发育分析证实了匍匐翦股颖与黑麦草（Lolium perenne）关系密切，符合APG IV分类系统。

图3 系统发育分析

上述研究成果以Complete Mitochondrial Genome of Agrostis stolonifera: Insights into Structure, Codon Usage, Repeats, and RNA Editing为题，在生物学领域二区Top期刊《BMC Genomics》（IF="4.4）发表。北京林业大学草业与草原学院硕士生李家兴为第一作者，晁跃辉副教授为通讯作者。本研究得到内蒙古自治区揭榜挂帅项目（2022JBGS00160302）的资助。

论文链接：https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-023-09573-1