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研究生创?/p>

喜讯:林木遗传育种学科硕士生陈磊发表1篇SCI论文

今日,我校林木遗传育种学科的09级硕士研究生陈磊皃/SPAN>论文〉/SPAN>Genome-wide identi?cation of cold-responsive and new microRNAs inPopulustomentosaby high-throughput sequencing》发表到亅/SPAN>SCI收录期刊、/SPAN>该研究通过Solexa高通量测序分析及生物信息学发现北京杨的74个保守miRNA序列,归?7个家族,来自杨树基因?54个位点;同时还发现了27新的miRNA序列及它们相对应的miRNA*s序列,来自杨树基因组35个位点。Solexa高通量测序来自感溃疡病和未感病北京杨的两个小RNA文库,并经分析发现:北京杨溃疡病总的保守miRNA的表达丰度比正常情况下高,而且33个miRNA序列表达量的变化非常显著,这些miRNAs的表达水平响应杨树溃疡病。qRT-PCR实验验证发现杨树溃疡miRNA表达量的变化趋势与Solxea测序一致。最后,生物信息学预测发现了3个保守miRNAs?个靶基因和新的miRNA?3个靶基因,而且对这些靶基因的功能进行了分析,发现靶基因涉及转录、新陈代谢以及胁迫等相关过程。本研究通过高通量测序鉴定了杨树中一批新的miRNA,结合荧光定量PCR分析了溃疡病菌侵染后杨树miRNA的表达变化,初步发现了与溃疡病菌侵染有关的杨树miRNA,为更好的理解林木抗溃疡病miRNA调控机理打下了初步基础

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