研究生创?/p>
生物学院博士生陈金辉研究工作在《New Phytologist》发?/h1>
时间?016-09-12
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近期，生物科学与技术学院林木遗传育种专业博士生陈金辉的学术论文‛SPAN lang=EN-US>Genetic variations and miRNA–SPAN lang=EN-US>target interactions contribute to natural phenotypic variations inPopulus”发表在国际著名植物学杂志〉SPAN lang=EN-US>New Phytologist》上（影响因子为7.21），指导教师为张德强教授，该研究得到了国家重点基础研究发展计划(973计划)等项目的资助、/SPAN>
先前大量研究表明＋SPAN lang=EN-US>miRNA及其靶基因内SNPs与人类疾病显著连锁，但在植物领域非编码基因等位变异研究鲜有报道。特别是，在多年生林木群体水平，miRNA基因不SPAN lang=EN-US>miRNA的靶基因结合位点在基因组上的SNP分布、效应等尚属空白，而本研究不仅填补了以上空白，并初步阐明了林木群体miRNA基因及其靶基因等位变异互作机制、/SPAN>
该研究首先采用高通量测序发现了一系列参与木材形成过程的关?SPAN lang=EN-US>miRNA及其靶基因，并对217 miRNAs基因咋SPAN lang=EN-US>1196个靶基因进行了毛白杨种质资源群体重测序工作。在上述基础上，系统分析了位于编码初?SPAN lang=EN-US>miRNA转录本（pri-miRNA）?SPAN lang=EN-US>miRNA前体＇SPAN lang=EN-US>pre-miRNA）茎环结构区、及其成熞SPAN lang=EN-US>miRNA基因组序列的SNP分布规律，发现了SNP主要位于pre-miRNA的颈环结构区咋SPAN lang=EN-US>miRNA非种子区域，且该籺SPAN lang=EN-US>miRNA基因皃SPAN lang=EN-US>SNP主要通过影响miRNA的加工过程和/或影哌SPAN lang=EN-US>miRNA-mRNA的相互作用而影哌SPAN lang=EN-US>miRNA的调控能力。同时，对靶基因结合位点上的SNP进行检测，发现亅SPAN lang=EN-US>SNP变异可通过导致自由能的改变或功能构象的消失，影哌SPAN lang=EN-US>miRNA与靶序列结合能力，甚至丧失其原有的调控功能，最终导致整个遗传调控网络的改变，全面揭示了miRNA基因和靶基因结合位点的在基因组上皃SPAN lang=EN-US>SNP分布、影响及相互作用。随后，采用多基因关联模型，并通过共表达分析和降解组测序验证，剖析亅SPAN lang=EN-US>miRNA基因与靶基因冄SPAN lang=EN-US>SNP对林木生长与木材纤维品质的加性、显性与上位性遗传效应，发掘了与木材品质显著关联的非编码基因冄SPAN lang=EN-US>SNP组合，建立了miRNA基因及其靶基因在木质纤维品质形成途径的上位性互作网络，研究为推动非编码RNA在林木数量遗传改良中的应用提供了全新的理论与策略、/SPAN>
文章第一作者是生物学院2013级在读博士生陈金辉。据悉陈金辉同学以第一作者在SCI收录杂志发表学术论文5篇，先后获得博士生国家奖学金、梁希优秀学子奖、挑战杯全国金奖、优秀学业辅导员等奖励、/SPAN>
附论文链接：
近期，生物科学与技术学院林木遗传育种专业博士生陈金辉的学术论文‛SPAN lang=EN-US>Genetic variations and miRNA–SPAN lang=EN-US>target interactions contribute to natural phenotypic variations inPopulus”发表在国际著名植物学杂志〉SPAN lang=EN-US>New Phytologist》上（影响因子为7.21），指导教师为张德强教授，该研究得到了国家重点基础研究发展计划(973计划)等项目的资助、/SPAN>
先前大量研究表明＋SPAN lang=EN-US>miRNA及其靶基因内SNPs与人类疾病显著连锁，但在植物领域非编码基因等位变异研究鲜有报道。特别是，在多年生林木群体水平，miRNA基因不SPAN lang=EN-US>miRNA的靶基因结合位点在基因组上的SNP分布、效应等尚属空白，而本研究不仅填补了以上空白，并初步阐明了林木群体miRNA基因及其靶基因等位变异互作机制、/SPAN>
该研究首先采用高通量测序发现了一系列参与木材形成过程的关?SPAN lang=EN-US>miRNA及其靶基因，并对217 miRNAs基因咋SPAN lang=EN-US>1196个靶基因进行了毛白杨种质资源群体重测序工作。在上述基础上，系统分析了位于编码初?SPAN lang=EN-US>miRNA转录本（pri-miRNA）?SPAN lang=EN-US>miRNA前体＇SPAN lang=EN-US>pre-miRNA）茎环结构区、及其成熞SPAN lang=EN-US>miRNA基因组序列的SNP分布规律，发现了SNP主要位于pre-miRNA的颈环结构区咋SPAN lang=EN-US>miRNA非种子区域，且该籺SPAN lang=EN-US>miRNA基因皃SPAN lang=EN-US>SNP主要通过影响miRNA的加工过程和/或影哌SPAN lang=EN-US>miRNA-mRNA的相互作用而影哌SPAN lang=EN-US>miRNA的调控能力。同时，对靶基因结合位点上的SNP进行检测，发现亅SPAN lang=EN-US>SNP变异可通过导致自由能的改变或功能构象的消失，影哌SPAN lang=EN-US>miRNA与靶序列结合能力，甚至丧失其原有的调控功能，最终导致整个遗传调控网络的改变，全面揭示了miRNA基因和靶基因结合位点的在基因组上皃SPAN lang=EN-US>SNP分布、影响及相互作用。随后，采用多基因关联模型，并通过共表达分析和降解组测序验证，剖析亅SPAN lang=EN-US>miRNA基因与靶基因冄SPAN lang=EN-US>SNP对林木生长与木材纤维品质的加性、显性与上位性遗传效应，发掘了与木材品质显著关联的非编码基因冄SPAN lang=EN-US>SNP组合，建立了miRNA基因及其靶基因在木质纤维品质形成途径的上位性互作网络，研究为推动非编码RNA在林木数量遗传改良中的应用提供了全新的理论与策略、/SPAN>
文章第一作者是生物学院2013级在读博士生陈金辉。据悉陈金辉同学以第一作者在SCI收录杂志发表学术论文5篇，先后获得博士生国家奖学金、梁希优秀学子奖、挑战杯全国金奖、优秀学业辅导员等奖励、/SPAN>
附论文链接：