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高精尖创新中心青年研究员毛建丰参与发表针叶树基因组学重要专著《The Spruce Genome《/div>
作者:| 发表时间?0-12-30| 阅读次数:

近日,北京林木分子设计育种高精尖创新中心青年研究员毛建丰参与到由美国、加拿大、英国、意大利、瑞典、挪威等国研究人员组成的国际团队,共同完成发表了针叶树基因组学领域重要专著《The Spruce Genome》。该专著由国际著名出版机 Springer 出版发行、/span>

构建针叶树高质量的基因组组装和基因注释、澄清基因组构成特征、揭示各类生长、代谢、木材品质形成的基因组基础是目前最受关注的研究热点。针叶林有重要的生态和林业价值,是森林经营的主体。针叶树提供着我国及全球范围大宗木材及纤维供应,同时提供着各类酚、醛、脂、多糖等重要化工原料。解析针叶树的生物学特性,对种质资源管理、种质改良、森林经营保护、木材及林产化工利用各个环节都有重要价值。比如,解析它的性状遗传特性,可以加速品种改良进程;澄清它的生物代谢机制,可以指导木材和代谢产物品质改良等。然而,针叶树基因组庞大,其大小是模式植物拟南芥的数百倍,是水稻、玉米、杨树、桉树等的数十倍。庞大的基因组、较长的生活史周期、复杂的遗传体系是针叶树基础研究的限制因素、/span>

重要专著《The Spruce Genome》以针叶树基因组学领域最为代表性的挪威云杉为对象,围绕针叶树基因组学中重要话题,对基因组大小、变异模式、基因家族构成、适应性遗传机制、萜和酚等重要化合物生物合成、基因组选择育种等主题进行了综述,归纳了已有发现,提出未来发展路径,为针叶树基因组学的未来发展提供了重要参考、/span>

在这部针叶树基因组学专著中,高精尖创新中心青年研究员毛建丰等贡献了一个章节,系统分析了针叶树 TPS 基因家族的组成、序列特征和表达模式。基于文献检索和数据收集,团队成员对挪威云杉、其它针叶树及陆生植物等类群基因组中?nbsp;TPS 基因进行了系统检索和鉴定,解析了它们的系统发育关系和结构特征。分析发现,大多数裸子植物的 TPS 基因分布在一个特异的亚家族(TPS-d)中 “DDXXD”和“RXR”等两个特征基序在挪威云杉的 TPS 基因中总体上高度保守;挪威云杉 TPS 基因表达上有显著差异,表明了其功能上的分化、/span>

最有趣的是,他们发现内含子较长 TPS 基因在不同组织器官中呈现了普遍的高表达,这为理解内含子的功能效应提供了参考。这项研究为深入分析针叶 TPS 基因的功能提供了基础,并对今后针叶树萜类代谢工程研究有重要价值、/span>

萜烯类(异戊二烯)化合物是重要的植物代谢产物,在植物生长发育中起着关键作用(如产生植物激素),参与植物生理活动的各个方面,它们也在抵御各种环境胁迫(无论是非生物的还是生物的)中发挥重要作用。同时,针叶树丰富的萜烯化合物,也是重要化工原料。萜烯合成酶(TPS)是决定萜烯功能多样性的核心酶,是解析萜烯生物合成机制的关键、/span>

北京林木分子设计育种高精尖创新中心青年研究员毛建丰为该章节通讯作者,博士生严雪梅是第一作者,博士生周姗姗和加拿大拉瓦尔大 Ilga Porth 教授参与了此项工作、/span>

该章节链接:

https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-030-21001-4_11

《The Spruce Genome》专著链接:

https://link.springer.com/book/10.1007%2F978-3-030-21001-4

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